Evaluación del uso de las tecnologías de secuenciación masiva en el diagnóstico genético del autismo

Los Trastornos del Espectro del autismo se consideran enfermedades complejas, cuya gran gran heterogeneidad clínica y genética, ha dificultado enormemente la identificación de los mecanismos moleculares que intervienen en su aparición. A pesar de existir evidencias solidas de una implicación genética, únicamente en una tercera parte de los casos, es posible encontrar la causa genéticamente responsable.

En los últimos años, tanto el análisis con microarrays cromosómicos como la secuenciación de exomas completos han mejorado considerablemente la detección de las causas genéticas de los TEA. Los microarrays cromosómicos permiten detectar pequeñas o grandes variaciones de ganancia o pérdida de material hereditario, mientras que la secuenciación de exomas completos detecta la presencia de mutaciones en los genes codificantes del genoma.

En la fase inicial de nuestro estudio, una muestra heterogénea de individuos diagnosticados con TEA fuero analizados mediante técnicas de microarray cromosómico (Panel de SNPs de alta densidad: CytoScan) que posibilitaron el diagnóstico genético en un 15% de los casos. Además se identificaron ciertas pautas clínicas para la identificación de pacientes con mayor probabilidad de recibir un diagnóstico molecular, puesto que la mayoría de casos considerados genéticamente “positivos”, se correspondían principalmente con formas sindrómicas de autismo o bien era mas probable que presentasen fenotipos clínicos que cursaban con mayor grado de afectación, sugiriéndose por tanto en todos ellos una mayor carga de organicidad.

Para todos los casos donde no fue posible esclarecer el origen genético del autismo o cuyos resultados se traducian en anomalías genéticas de significado incierto, la secuenciación exómica se presenta como una segunda técnica de analisis genético enormemente prometedora pues se piensa que puede incrementar el rendimiento diagnóstico hasta un 45%.Para llevar a cabo esta tarea, contamos con la colaboración del Consorcio Internacional de Autismo, en cuyos laboratorios se realiza tanto la secuenciación de los exomas de los menores participantes en el estudio como de sus padres.

En aquellos individuos donde la secuenciación de exomas permita identificar mutaciones que afecten a un único gen causal, será posible ofrecer un nuevo asesoramiento genético a las familias implicadas, trasladando así los resultados de la investigación a la práctica clínica.

La identificación de mutaciones implicadas en el desarrollo de los TEA posibilitará la clasificación molecular de los TEA en diferentes subgrupos etiológicos. Por otro lado, el estudio en detalle de los genes mutados así como el análisis de las funciones biológicas afectadas por estos genes contribuirá en última instancia a esclarecer los mecanismos etiopatogénicos  implicados y con ello posibilitará el desarrollo de estrategias terapéuticas dirigidas específicamente a reparar las causas biológicas que están detrás de estos trastornos.

COLABORACIONES: Consorcio Internacional de Autismo

OBJETIVOS: Contribuir a esclarecer la causalidad genética de los TEA

HITOS A CONSEGUIR:

1 Identificación de potenciales mutaciones causales o recesivas vinculadas a TEA.

2 Proceder con nuevos consejos genéticos en las familias donde haya sido posible identificar una alteración genética con posible relevancia patológica para su trastorno neuropsiquiátrico (TEA).

3 Definir los correspondientes fenotipos clínicos, morfológicos y neuropsicológicos en aquellos probandos que tras ser re-analizados genéticamente mediante la secuenciación de exomas, han sido reconvertidos e en casos genéticamente positivos.